WebSearch all packages and functions. DOSE (version 2.10.6). Description Usage WebJan 6, 2024 · 前言. 关于clusterProfiler这个R包就不介绍了,网红教授宣传得很成功,功能也比较强大,主要是做GO和KEGG的功能富集及其可视化。. 简单总结下用法,以后用时可直接找来用。. 首先考虑一个问题:clusterProfiler做GO和KEGG富集分析的注释信息来自哪里?. GO的注释信息 ...
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WebApr 12, 2024 · 最开始,由此需求想到的就是Y叔的一个包,enrichplot::cnetplot(kk2,showCategory = 22,circular=F,colorEdge = TRUE)) ... 导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析,用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 ... Web对输入数据矩阵运行自定义距离函数: CustomPalette: 创建自定义调色板: DarkTheme: 修罗主题: DefaultAssay: 获取并设置默认分析: DefaultAssay.Assay: 获取并设置默认分析: DefaultAssay.DimReduc: 获取并设置默认分析: DefaultAssay.Graph: 获取并设置默认分析: DefaultAssay.Seurat: 获取并设置 ... glass top caskets
start-docker-project/publish.yaml at main - Github
WebJan 30, 2024 · showCategory: number of enriched terms to display. color: variable that used to color enriched terms, e.g. pvalue, p.adjust or qvalue. layout: layout of the map... WebMar 1, 2024 · Barplot画法. Barplot只需要两组数据即可:柱子的长度和名称,如果还想显示P值的话,我们可以按P值设置颜色。 简单的图可以见Figure 1所示,也就是clusterprofiler中barplot()的效果。. clusterprofiler得意之处就是按照大小对柱子的长度进行了排序,这个功能可以通过forcats包的fct_reorder()调整因子level的顺序显示 ... WebFeb 5, 2024 · VennDiagram包提供了2到5个集合的绘图函数:包括绘制两个集合的韦恩图的draw.pairwise.venn,三个集合的draw.triple.venn,四个集合的draw.quad.venn,五个集合的函数draw.quintuple.venn。 安装并加载VennDiagram包. Install.packages(“VennDiagram”)library(VennDiagram) glass top cabinet 14